提供サービス

連携基盤

AMEDが運用する「AMEDデータ利活用プラットフォーム」の一システムです。
「統合UI/UX（※１）」、「メタデータの横断検索」、「層別アレル頻度情報（※２）の閲覧」、「ID管理・連携」、「認証」等の機能を有します。

• ※１ UI：User Interface、UX：User Experience
• ※２ 層別アレル頻度：データ提供機関より提供された全ゲノムデータセットを臨床基本４属性情報でグループ化した場合に、そのグループで観測される特定のアレルの出現頻度

連携拠点におけるシステム

個人情報にあたる全ゲノムデータを保管し、全ゲノムデータの統計処理ができる、「AMEDデータ利活用プラットフォーム」の情報システムです。
東京大学医科学研究所と東北大学東北メディカル・メガバンク機構は計算ノードとストレージを有します。国立遺伝学研究所、国立がん研究センター、国立国際医療研究センターはストレージのみを有します。

計算リソース

東京大学医科学研究所

ノード種類	コア数	メモリ	ノード数
CPUノード	48コア	192Gb	2ノード
GPUノード	128コア	1Tb	1ノード

東北大学東北メディカル・メガバンク機構

ノード種類	コア数	メモリ	ノード数
CPUノード	128コア	512Gb	20ノード
GPUノード	－	－	－